当地时间 16 日，以色列总理内塔尼亚胡表示，以色列空军已经掌控伊朗首都德黑兰上空的空域。他还说，我们正告德黑兰市民 " 撤离 " 德黑兰，" 我们将采取行动 "。

当地时间下午 5 时，记者在德黑兰听到南部地区传出剧烈爆炸声。

15 日下午至 16 日凌晨，以色列袭击对德黑兰北部尼亚瓦兰、塔吉里士、瓦利亚斯尔等人口密集的繁华地带造成数场爆炸。以色列还袭击了伊朗外交部、司法部、警察总部、伊斯兰革命卫队情报部门和德黑兰梅赫拉巴德国际机场，造成革命卫队情报部分负责人卡齐米及其副手哈桑 · 穆哈盖尔以及另一名高级将领穆赫辛 · 巴盖里身亡。

15 日起，大批德黑兰民众乘车前往郊区和北部地区避险，造成德黑兰市区主要道路和出城干线严重拥堵。

伊朗副外长赛义德 · 哈提卜扎德表示，伊朗外交部一座建筑当天遭以色列袭击，造成多人受伤。受伤人员中包括几名外交部职员，他们已被送往医院接受治疗。他还说，这是以色列又一起公然的战争罪行，是针对伊朗持续进行的系统性和侵略性行动的一部分。

16 日，伊朗外交部发言人巴加埃表示，以色列对伊朗的袭击违反了国际法，呼吁世界各国向以色列施压，要求其停止对伊朗的侵略，呼吁联合国安理会谴责以色列的袭击。巴加埃表示，以色列的袭击扰乱了外交（谈判）进程，美国应该为此负责。在这种情况下讨论谈判是没有意义的。

巴加埃还表示，以色列对伊朗核设施的袭击是史无前例的，伊朗对以色列的回应符合国际法，伊朗仍然反对大规模杀伤性武器。