文汇 08-20
基因“胶卷”如何打开?我国科学家揭秘“放映专家”RFX5调控机制
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近日,同济大学附属上海市第四人民医院教授许可、尹贻蒙,上海有机化学研究所研究员张一小,以及清华大学生命科学学院副教授陈春来团队,在国际期刊《核酸研究》发表最新合作研究成果。

他们在国际上首次从结构层面,揭示了先锋转录因子 RFX5 如何结合核小体并调控其状态,破解了这一 " 基因放映专家 " 打开基因 " 胶卷 " 的分子机制。

这一发现,为理解基因表达调控机制提供了关键视角,也为类风湿性关节炎、肝细胞性肝癌、胃腺癌、结直肠癌、弥漫性大 B 细胞淋巴瘤等相关疾病的研究与治疗奠定基础。

许可教授介绍,细胞中的基因像一本超长的 " 电影剧本 ",而 DNA 就像电影里的胶卷,承载着所有剧情内容。但这条胶卷并不是摊开在桌面上的,而是被紧紧卷在组蛋白组成的 " 卷轴 " 上,形成称为核小体的结构,从而使胶卷处于一个牢固的状态。这也会让大部分剧情平时无法播放,起到保护内容并防止随意改动的作用。

但当需要播放电影的时候,需要把胶卷打开。这时有一类拥有特殊钥匙的 " 放映专家 ",科学家称为先锋转录因子,能够先把卷在卷轴上的胶卷拉出来,为后续的 " 助手团队 "(其他因子)创造机会,让它们进入,开始播放或者调整剧情,从而决定细胞未来的命运。

在这些 " 放映专家 " 中,RFX5 是其中之一,它参与调控免疫系统中非常关键的基因开关。如果它坏了,人会得一种叫 " 裸淋巴细胞综合征 " 的严重疾病。以前,科学家知道 RFX5 能拉出胶卷,但它具体怎么做到,一直没有被看到。

研究团队借助冷冻电镜技术,在国际上首次捕捉到 RFX5 与核小体的结合画面。结果显示,RFX5 的延长 DNA 结合域(eDBD)能精准结合核小体的 SHL+2 关键位置:一方面牢牢抓住 DNA" 胶卷 ",另一方面通过 Glu102 位点像 " 小钩子 " 般钩住组蛋白 " 支架 ",促使部分 DNA 扭转并带动外层 " 胶卷 " 从核小体脱出。这种与组蛋白直接接触的方式,被证实是 RFX5 发挥作用的关键,且可能为先锋转录因子的共有机制。

为验证这一发现,这个团队通过 " 分子剪刀 "(MNase 酶切)实验和 " 分子距离探测 "(FRET)实验证实:RFX5 结合后,核小体上的 DNA 更易被酶切、末端距离显著增大,直接证明其能将 " 胶卷 " 拉出,使基因信息处于可读取状态。

进一步研究发现,RFX5 可在核小体不同位置结合,如同经验丰富的 " 放映专家 " 灵活操作;尤其在 SHL+2 位置时,拉出的 DNA 能为其他转录因子提供进入通道,助力更多基因 " 剧情 " 顺利表达。

该研究明确了 RFX5 的三大核心作用:精准结合核小体特定位置并稳固 " 开锁 "、将 DNA" 胶卷 " 拉出以开放基因信息、为后续转录因子创造作用通道。

据悉,许可、尹贻蒙、张一小、陈春来为该论文共同通讯作者,同济大学薛皖强、田英,上海有机化学研究所韩瑶瑶,清华大学生命科学学院王君正为共同第一作者。

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